Režiséra, scenáristu a producenta Viktora Taranskeho (Al Pacino) prenasleduje smola. Jeho posledný film bol prepadák, utiekla mu hviezda jeho nového filmu a štúdio mu zrušilo zmluvu. Napadne ho použiť ako náhradu digitálne vytvorenú herečku Simone a tá sa stane senzáciou!
Mutanti sú ľudia s nadprirodzenými schopnosťami, ktorých odlišnosť sa prejaví až v puberte a spôsobuje ju evolučný skok ľudského druhu. Cynický dospelý Magneto, ktorý ovláda kovové veci pomocou magnetického poľa, očakáva vojnu medzi príslušníkmi svojho druhu a obyčajnými...
Príbeh sleduje Charlesa Xaviera a Erika Lensherra ešte predtým, ako prijali mená Profesor X a Magneto. V tom čase bývali veľmi blízkymi priateľmi pracujúcimi na spoločnom projekte – zabrániť spolu s ďalšími mutantmi najhoršej hrozbe, akú kedy ľudstvo poznalo.