V treťom diele sa korytnačí nindžovia a April vďaka náhodnej kúpe tajomného a čarovného žezla dostanú do stredovekého Japonska. Namiesto nich sa v súčasnosti objavia japonský princ a štvorica samurajských bojovníkov. Lenže žezlo sa stratilo pri prenose, a tak ho musí štvorica...
