Sú tomu dva roky, čo sme naposledy navštívili rodinu myšiaka Stuarta Littla. Odvtedy sa mnohé zmenilo - Stuart je o niečo starší a spokojne žije novým štýlom života. Cestuje do školy vo svojom vlastnom aute, naučil sa lepiť modely lietadiel a je pyšný na to, že sa mu podarilo...
Film nám ukáže že vo výrobe liekov a rôznych prípravkov sú veľké peniaze. Sú dve veľké farmaceutické firmy. Obidve prichádzajú s rôznymi novinkami. Čo by im však pomohlo? Zistiť čo robí a čo vymýšľa ich konkurencia. A to je práve čas vyslať profesionálnych...