Khan, geneticky upravený „nadčlovek“ s megalomanským sklonmi, bol po porážke v eugenických vojnách vyhnaný na opustenú planétu Ceti Alpha 5. Prisahal pomstu kapitánovi Kirkovi, ktorého viní za svoje vyhnanstvo ako aj za smrť svojho syna. Keď sa mu po dlhých rokoch naskytne...
Po dlhotrvajúcich vojnách sa Federácia a Klingonská ríša pripravujú na mierový summit. Je to možno posledná šanca na mier medzi odvekými rivalmi. Kapitán Kirk a jeho posádka sú poverení uvítaním najvyššieho kancelára Klingonov. Potom, čo je klingonská loď záhadne zničená...
Porážka Khana admirálom Kirkom a stvorenie novej planéty Genesis sú len prázdnym víťazstvom. Spock položil svoj život za záchranu posádky a McCoy sa nevysvetliteľne stal choromyseľným. Náhle na Enterprise priletí Sarek, Spockov otec, a odhalí neuveriteľnú vec: McCoy prechováva...
