V druhom pokračovaní trilógie Matrix Neo spoločne s Morphom a Trinity bojujú proti počítačovým vládcom univerza. Chcú zastaviť zotročenie ľudstva a nemajú inú možnosť ako boj na život a na smrť. Sú nútení preniknúť hlboko do štruktúr Matrixu a v priebehu sedemdesiatich...
Špeciálne policajné komando má za úlohu preniknúť do prísněle stráženého domu a zneškodniť šéfa gangu. Tým je však skoro prezradený a zbytok nájemníkov stojí pred jednoduchou volbou. Keď sa nepridajú na policajnú stranu, budú už navždy bývať zadarmo...