Počítačovému špecialistovi Thomasovi Andersonovi, ktorý sa však najlepšie vo svojej koži cíti, len keď sa ukryje za svoj nick Neo, sa jedného dňa konečne podarí skontaktovať sa so skupinou odbojárov, združenou okolo tajomného Morphea, ktorý ho zanedlho zasvätí do tajomstva,...
V druhom pokračovaní trilógie Matrix Neo (Keanu Reeves) spoločne s Morphom (Laurence Fishburne) a Trinity (Carrie-Anne Moss) bojujú proti počítačovým vládcom univerza. Chcú zastaviť zotročenie ľudstva a nemajú inú možnosť ako boj na život a na smrť. Sú nútení preniknúť...