V obrovskej plážovej sídle sa Pikachu a niektorí z jeho kamarátov rozhodli hrať schovávačku. Pikachu sa preto vydáva hľadať svojich priateľov. Medzitým Larvitar, chorý z toho, že je úplne sám, v hneve kopne do skaly. Skala sa rúti vzduchom - a zasiahne kosačku, zapne ju a odošle...
Vodca Rakeťákov, Giovanni, konečne dopátral. V odľahlej oblasti regióne Johto našiel Mewtwoa, ktorého sa okamžite snaží odchytiť. Ash a jeho priatelia sú unesení Dominou, novou členkou Rakeťákov, a zároveň sa snažia zachrániť Pikachua, ktorého zase majú Jessie a James....
Ash, Misty a Tracey sa rozhodli zobrať všetkých svojich Pokémonov a vyraziť niekam. Počas spánku Togepi spadne zo strmého kopca a zmizne v diere. Za Togepi sa vyberú Pikachu, Bulbasaur, Squirtle, Marill, Venonat a Psyduck. Skončia na obrovskom strome, kde sa zdá, že v ňom predtým žil...
