Mewtwo, Pokémona vytvoreného pomocou bioinžinierstva z DNA Mew, jedného z najvzácnejších Pokémonov zo všetkých. Po jeho úteku z laboratória, kde bol vytvorený, je Mewtwo odhodlaný dokázať svoju vlastnú nadradenosť. Láka množstvo talentovaných trénerov do bitky Pokémonov ako...
Ash, Pikachu a pokémonskí kamaráti v lese stretnú Sammyho, ktorý prišiel z minulosti. Sammy chce zachrániť Pokémona Celebiho, Ducha lesa, ktorý uteká pred zlým lovcom Pokémonov. V prítomnosti chce ale Celebiho chytiť ešte nebezpečnejší nepriateľ - maskovaný zloduch Marauder,...
Nad Greenfieldom sa rozpútala krištáľová katastrofa a Ash, Pikachu a priatelia musia prísť na to, ako napraviť škody na kedysi krásnom meste. Stane sa však nemysliteľné, keď Ashovu matku unesie mocný Entei, o ktorom sa predpokladalo, že Pokémon existoval iba v legendách. Teraz sa...
Ash, May, Brock a Max prichádzajú na festival Wishing Star of Seven Nights (Sedem nocí hviezdy želania). Počas toho, ako sa zabávajú, legendárny Pokémon Jirachi zostupuje z nebies a spriatelí sa s Maxom. Jirachi, ktorý má moc splniť akékoľvek želanie, je vyhľadávaný mnohými...
Ash, Pikachu a jeho priatelia sa snažia zastaviť dvojicu zlodejov, ktorí sa skrývajú v kanáloch a uličkách Altomare, starodávneho vodného mesta. K dobrodružstvu sa pripoja aj dvaja noví legendárni Pokémoni, dvojica súrodencov menom Latias a Latios, ktorí slúžia ako strážcovia...
Ash, Misty a Tracey sa rozhodli zobrať všetkých svojich Pokémonov a vyraziť niekam. Počas spánku Togepi spadne zo strmého kopca a zmizne v diere. Za Togepi sa vyberú Pikachu, Bulbasaur, Squirtle, Marill, Venonat a Psyduck. Skončia na obrovskom strome, kde sa zdá, že v ňom predtým žil...
